В институте инженерной физики и радиоэлектроники создано несколько научно-образовательных центров и лабораторий:

• НОЦ Радиоэлектроника:
  • НИИ «Радиотехника»
  • Лаборатория антенн и техники СВЧ
  • Студенческое конструкторское бюро
• НОЦ Фотоника и лазерные технологии:
  • Лаборатория Биофотоники
• Лаборатория Нанотехнологий, спектроскопии и квантовой химии
• НОЦ Теплофизика и энергетика
• НОЦ Наноразмерные и перспективные материалы и нанотехнологии